Aan boord van binnenschepen, zoals de 'Helena', wordt al het huishoudelijk afval opgespaard en aan de wal afgegeven, net als in een gewoon huishouden. Op zeeschepen, zeker tijdens langere reizen, is dat niet zo eenvoudig. Daarom wordt daar aan boord het afval zorgvuldig gescheiden. Organisch materiaal zoals etensresten, wordt op zee overboord gezet. Blikjes en metalen worden gescheiden ingezameld en samengeperst , evenals plastic en ander huisvuil. Pas in een haven wordt dit afval afgegeven.
Afvalwater wordt verzameld in tanks in het schip. In sommige havens kan dit aan speciale walinstallaties worden afgegeven, maar lang niet overal. Op volle zee mag dit afvalwater overboord worden gepompt. Daarom gebruiken we als het even kan uitsluitend milieuvriendelijke schoonmaakmiddelen.